Abitato, in et precolombiana, prima dai maya e poi dai Pipil, El Salvador venne conquistato nel 1524 dal conquistador Pedro de Alvarado che scacci definitivamente i Pipil e fu causa, per anni, di violenti conflitti.
Fu proprio il fratello di Pedro, Diego, a fondare la citt di San Salvador, attualmente capitale del Paese.
Soltanto nel 1841 El Salvador diventa una Repubblica indipendente, mettendo fine ad oltre trecento anni di dominazione spagnola.
Nonostante tutto il Paese continu ad essere tormentato da diversi conflitti nel tentativo di riportare la pace e l'unione.
Ancora oggi, dopo la conclusione della guerra civile (1 gennaio 1992), El Salvador sta portando avanti un grande processo di democratizzazione.