Comalapa l'aeroporto internazionale del Paese ed situato a 44 chilometri dalla citt di San Salvador.
Dall'Italia, l'unico volo diretto viene effettuato dalla compagnia Livingston che collega Milano Malpensa - San Salvador; diversamente necessario effettuare almeno uno scalo.
La compagnia aerea nazionale la Taca.
Il paese dispone di tre porti principali situati a Punta Gorda, Puerto de la Union e Acajutla e di una rete ferroviaria.
Il servizio di autobus ottimo, con corse regolari e tariffe convenienti; l'unico problema che, spesso, sono affollati.
Poich la rete stradale molto spesso non asfaltata, non molto consigliabile noleggiare un'auto per spostarsi all'interno del Paese.