Due aeroporti internazionali servono lo stato del Missouri: il Lambert-St. Louis International Airport a Saint Louis ed il Kansas City International Airport a Kansas City, con voli delle maggiori compagnie aeree nazionali ed internazionali.
I trasporti ferroviari sono particolarmente sviluppati ed efficienti.
La citt Saint Louis servita dalla metropolitana St. Louis MetroLink.
Buone le reti autostradali e abbastanza sfruttato il trasporto fluviale sui due grandi fiumi dello stato.