A eccezione dell'estremit meridionale, il Madagascar interamente compreso tra i tropici. Tuttavia gli 'hauts plateaux', che si stendono per l'intera lunghezza dell'isola, formandone la spina dorsale, presentano un clima sufficientemente mite da consentire la crescita di meli e noccioli e persino vigneti, sopra gli 800 m. Alle altitudini pi elevate, durante l'inverno cade spesso la neve.
Gli alisei soffiano da est e i monsoni da nord-ovest.
Gran parte delle piogge cadono sulla costa orientale e nell'estremo nord, mentre a sud-ovest degli altipiani, il clima rimane quasi sempre secco. Da gennaio a marzo, la costa orientale, l'estremo nord e, talvolta, l'estremo sud, vengono colpiti da occasionali cicloni devastanti.