L'Iowa confina a nord con il Minnesota, ad ovest con Nebraska e Dakota del Sud, a sud con il Missouri e ad est con Wisconsin ed Illinois.
Il territorio, prettamente pianeggiante, attraversato e delimitato da alcuni fiumi principali: il Mississippi, il Missouri e il Big Sioux River.
La parte occidentale caratterizzata dalla presenza di colline di materiale sedimentario, mentre a nord-est il paesaggio completamente diverso dal resto dello stato per la presenza della Driftless Zone, un terreno la cui origine glaciale ha lasciato profondi segni nella topografia.
Tra i laghi del paese, lo Spirit, il West Okoboji e l'East Okoboji sono laghi naturali, mentre il Lago Odessa, il Saylorville, il Red Rock, il Coralville, il McBride e il Rathbun sono laghi artificiali.
L'Iowa ha la pi alta concentrazione media di radon di tutti gli Stati Uniti e questo pu comportare pericoli in prossimit di centri abitati. Molte citt hanno, pertanto, stabilito che le nuove abitazioni rispondano a requisiti di particolare resistenza al radon.