Il clima del Gennargentu è sostanzialmente di tipo mediterraneo, caratterizzato da temperature miti e precipitazioni concentrate prevalentemente nel periodo compreso tra l'autunno e l'inizio della primavera. Alle quote più elevate, invece, il clima è di tipo mediterraneo freddo, le cui caratteristiche hanno reso possibile la conservazione delle specie vegetali tipiche delle zone di alta montagna. In queste zone l'inverno è caratterizzato da frequenti nevicate anche se l'intensità e la copiosità delle precipitazioni non consentono la formazione di un manto nevoso di spessore significativo.