La superficie della regione � divisa quasi equamente tra zone di montagna, e zone collinari,del territorio. A oriente, la zona del Subappennino (Monti dei Frentani) digrada verso il mare con colline poco ripide e dalle forme arrotondate.I fiumi principali della regione sono il Trigno e il Biferno.Nel Molise, oltre ad essere presente il Parco Nazionale d'Abruzzo sono presenti vaste aree boschive, soprattutto nella Provincia di Isernia, che la rendono ricca di specie vegetali oltre che animali.